Vláda uzavřela spor týkající se Temelína a střetla se s Respektem

Uzavřít vleklý spor s Rakouskem o jadernou elektrárnu Temelín, dostat se s 24 uzavřenými kapitolami mezi první kandidátské země na vstup do Evropské unie, a vyhlásit a uzavřít výběrové řízení na stíhačky stačila v roce 2001 vláda. Kabinet také změnil složení, střetl se s týdeníkem Respekt a kromě pochvaly od Evropské unie sklidil i její kritiku za obcházení výběrových řízení na státní zakázky. Brusel kritizoval fakt, že vláda často využívá zákonné výjimky a zadává státní zakázky bez tendru. Média se pozastavovala i nad malou průhledností některých řízení. Například tendr na stíhačky, největší zakázku v historii české armády, opustili čtyři z pěti zájemců pro údajně neprůhledné praktiky a diskriminační podmínky. Ač ministři nebyli jednotní, zda vůbec vítěze řízení vyhlásit, stal se jím nakonec jediný zbylý uchazeč, britsko-švédské konsorcium BAe Systems - Saab. Problémy u státních zakázek kritizoval i komentář týdeníku Respekt, který obviňoval ministry z korupčního chování a spustil tak ostrý spor vlády s médii. Premiér Miloš Zeman totiž pohrozil trestním oznámením na autora komentáře, šéfredaktora týdeníku Petra Holuba a sérií ministerských žalob o náhradu škody, "aby Respekt konečně zanikl" a vyvolal tak bouři na mediální scéně. Vláda se obměnila i personálně. Údajné dlouhodobé spory s ministrem průmyslu a obchodu Miroslavem Grégrem stály v pozadí dubnové rezignace ministra financí Pavla Mertlíka. I on kritizoval malou vládní podporu průhlednosti hospodářských procesů. Mertlíka nahradil tehdejší náměstek ministra práce a sociálních věcí Jiří Rusnok. Druhá změna nastala v křesle ministra obrany, v němž vystřídal Vladimíra Vetchého jeho náměstek Jaroslav Tvrdík. V listopadu se vládě podařilo uzavřít takzvaný melkský protokol a dlouhý spor s Rakouskem Jaderné elektrárně Temelín. Konečné schůzce předsedů vlád a komisaře Güntera Verheugena v Bruselu předcházela několikaměsíční horečná zákulisní vyjednávání ministrů Jana Kavana a Wilhelma Molterera a do posledního dne nebylo jasné, jak bude dohoda vypadat. Vídeň nakonec prosadila, že české závazky týkající se zajištění bezpečnosti Temelína budou v protokolu k přístupové dohodě k EU.