Česká republika se připojila k zemím EU a pátek vyhlásila dnem státního smutku
Vláda vyhlásila pátek 14. září dnem státního smutku a vyzvala obyvatelstvo, aby ve 12:00 uctilo památku obětí útoku proti USA třemi minutami ticha. V poledne se rozezvučí sirény, státní vlajky na veřejných a úředních budovách budou staženy na půl žerdi.
Po čtvrtečním mimořádném zasedání kabinet rovněž oznámil, že Česká republika je připravena posoudit formy pomoci Spojeným státům včetně vojenské, a plnit tak závazky vyplývající z členství v Severoatlantické alianci (NATO). Vláda je spolu s ostatními ústavními činiteli připravena plnit úkoly v souladu s usnesením Severoatlantické rady podle pátého článku Washingtonské smlouvy.
Pokud by se čeští vojáci zúčastnili vojenské akce, která by trvala nanejvýš 60 dnů, má vláda právo rozhodnout o jejich vyslání sama bez hlasování parlamentu. Zákonodárný sbor by pouze musela o svém rozhodnutí informovat. Kdyby se však čeští vojáci měli zapojit do operace delší než 60 dní, musel by parlament o jejich vyslání mimo území ČR hlasovat. Vzhledem k rozložení sil v obou parlamentních komorách a prvním reakcím zákonodárců se dá očekávat, že parlament by nasazení vojáků podpořil.
"Pokud by Spojené státy požádaly českou armádu o pomoc, měly by zřejmě zájem spíše o symbolickou účast malých omezených jednotek v doplňkových oblastech služeb". Ve čtvrtek večer to řekl ministr obrany Jaroslav Tvrdík s tím, že jakékoli spekulace o tom, jak bude případný požadavek americké strany vypadat, jsou předčasné.
Ve čtvrtek večer přijal prezident Václav Havel ředitele všech čtyř zpravodajských služeb, aby ho informovali o aktuální bezpečnostní situaci. V České republice fungují dvě vojenské a dvě civilní zpravodajské služby. Podle ředitele civilní rozvědky Františka Bublana mají i ony šanci přispět k objasnění pozadí útoku, zaměřeného na budovy v New Yorku a Washingtonu. Hlasy, které v souvislosti s atentáty obviňují ze selhání americké zpravodajské služby, ředitel Bublan odmítá.
České aerolinie dnes znovu nepoletí do USA. Firma kvůli opětovnému uzavření vzdušného prostoru nad USA byla nucena zrušit dva na dnešek plánované lety na newyorská letiště. ČSA do New Yorku nelétají od úterního teroristického útoku po kterém USA uzavřely svůj vzdušný prostor. Veškerý ostatní provoz probíhá podle platného letového řádu, avšak za mimořádných bezpečnostních podmínek z důvodu bezpečnosti cestujících, posádek letadel a letadel samotných.