Čeští vědci budou mít nově přístup k evropským genomickým datům z biomedicíny

Čeští vědci budou mít nově přístup k evropským genomickým datům z biomedicínského výzkumu. Na 1. lékařské fakultě Univerzity Karlovy (UK) ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR vzniká úložiště, které vědcům z České republiky umožní sdílet data v celoevropské platformě FEGA. Univerzita o tom informovala v tiskové zprávě. "Sdílení a opakované využití rozsáhlých genomických a s nimi souvisejících medicínských dat je zcela klíčovou podmínkou pro naše možnosti objasňovat podstatu a příčiny vzácných genetických onemocnění a pro rozvoj personalizované medicíny," uvedla Věra Franková z Ústavu humanitních studií 1. lékařské fakulty UK. Pro to, aby mohla vědecká komunita výzkumná data sdílet, je nutné je uchovávat v jednotném formátu. Nově vznikající společné pracoviště univerzity s ústavem bude provozovat bezpečné datové úložiště pro citlivá genomická data. Zároveň vytvoří datový uzel pro sdílení v rámci FEGA (Federated European Genome-phenome Archive). Takzvaný federovaný systém umožňuje, aby lokálně uložená data neopouštěla místo svého vzniku. "Zároveň ale umožňuje, aby byla prostřednictvím propojených uzlů v jednotném formátu dostupná pro další výzkumníky, kteří mají oprávnění k jejich využití," přiblížil bioinformatik Jiří Vondrášek z ústavu.